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LRZ-Newsletter Nr. 03/2019 vom 07.03.2019

Unsere Themen:

Neuigkeiten

Ausgerechnet! Unser Universum

Die neue Planetariumsshow im Deutschen Museum zeigt, wie Münchner Wissenschaftler mit SuperMUC die Geschichte des Weltalls simulieren.

Was geschah nach dem Urknall? Wie entstehen Sterne und Galaxien? Welche Rolle spielt dabei die Dunkle Materie? Um zu verstehen, wie sich unser Universum entwickelt, haben Wissenschaftler mit Hilfe des Hochleistungsrechners SuperMUC aufwendige und spektakuläre Simulationen erstellt. In Zusammenarbeit mit dem Münchner Exzellenzcluster Universe und dessen Nachfolger Origins, in denen verschiedene wissenschaftliche Institutionen zusammengeschlossen sind, ist daraus nun eine neue Fulldome-Show entstanden, die künftig regelmäßig im Planetarium des Deutschen Museums gezeigt wird. Als Sprecher für die ca. 30-minütige Show konnte der bekannte Forscher und Wissenschaftsjournalist Harald Lesch gewonnen werden.
Mehr dazu hier im Pressetext des Deutschen Museums.

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New PRACE Best Practice Guides

Under the leadership of LRZ the Partnership for Advanced Computing in Europe (PRACE) has published 6 new Best Practice Guides under http://www.prace-ri.eu/best-practice-guides/

  • Best Practice Guide – Deep Learning, February 2019 PDF , HTML
  • Best Practice Guide – Modern Interconnects , February 2019 PDF , HTML
  • Best Practice Guide – ARM64, February 2019 PDF , HTML
  • Best Practice Guide – Parallel I/O, February 2019  PDF , HTML
  • Best Practice Guide – AMD EPYC, February 2019 PDF , HTML
  • Best Practice Guide – HPC for Data Science on the Cray Urika, January 2019 PDF , HTML

Topics for these Best Practice Guides include: a short description of the processor architecture, optimal porting of applications (e.g., choice of numerical libraries and compiler options); architecture specific optimisation and scaling techniques; optimal system environment (e.g., tuneable system parameters, job placement and optimised system libraries); debugging tools, performance analysis tools and programming environment.

Autor: Volker Weinberg

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GCSnews des Gauss Centre for Supercomputing (GCS)

Die aktuelle Ausgabe der GCSnews des Gauss Centre for Supercomputing (GCS) finden Sie hier . Alle Ausgaben sind über die Webseite des GCS verfügbar.

Das Gauss Centre for Supercomputing(GCS) ist der Zusammenschluss der drei nationalen Höchstleistungsrechenzentren in Deutschland (FZ Jülich, HLRS in Stuttgart und LRZ in Garching bei München). GCS ist der deutsche Partner in der Partnership for Advanced Computing in Europe (PRACE).

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Infobrief der Gauß-Allianz

Die Gauß-Allianz (GA) ist der Zusammenschluss von 18 Rechenzentren und Institutionen in Deutschland zur nachhaltigen und effizienten Nutzung von Supercomputing-Ressourcen der obersten Leistungsklassen. Hier finden Sie die aktuelle Ausgabe des GA-Infobriefs.

Die Gauß-Allianz schreibt den Namen des großen Mathematikers mit "ß", das Gauss Centre schreibt seinen Namen in britischem Englisch mit "ss" statt "ß".

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PRACE Newsletter

PRACE, the Partnership for Advanced Computing in Europe , was established in 2010 to create a persistent pan-European Research Infrastructure (RI) of world-class supercomputers. This infrastructure is currently made up of seven leading edge machines, hosted by five member countries, (France, Germany, Italy, Spain and Switzerland) and is accessible through an open peer-review process, complemented by national resources operated and accessible via High Performance Computing (HPC) centres throughout Europe. To receive PRACE' newsletter, please go to http://www.prace-ri.eu/subscribe-to-prace-gdpr-compliance/

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Termine, Kurse und Veranstaltungen

Call deadline: March 11: EuroHPC Summit Week 2019, May 13-17

The EuroHPC Summit Week 2019 will gather together the main HPC stakeholders in Europe. PRACE will be part with PRACEdays19 at the EuroHPC Summit Week 2019 from 13 to 17 May 2019 in Poznań, Poland. The PRACEdays19 Call for Contributions and Posters is open until 11 March 2019, please read further details here:

PRACE is happy to receive your nomination for the PRACE Ada Lovelace Award for HPC. Please follow the link: http://www.prace-ri.eu/ada-lovelace-award-2019/

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Upcoming PRACE Courses at LRZ

There are still free places for the following PRACE courses at LRZ:

PRACE Course: Advanced Topics in High Performance Computing

Date: Monday, March 18 - Thursday, March 21, 2019, 9:00-17:00
Location: LRZ
Lecturers: R. Bader, S. Mendez, V. Weinberg (LRZ), J. Eitzinger (RRZE), Andrey Semin (Intel)
Registration deadline extended until 10 Mar 2019!

Topics: Processor-specific optimization, parallel I/O with MPI IO, Tuning I/O on LRZ's HPC systems, I/O profiling: Darshan tool, scientific data libraries: HDF5, scalable I/O library: SIONlib, PGAS programming with coarray Fortran and Unified Parallel C.

We are happy to announce that during the course Andrey Semin (Intel) will give a special public lecture about the Intel Xeon Scalable (Skylake) processor architecture (Hörsaal, H.E.009).

This lecture will be devoted to the Intel Xeon Scalable (codenamed Skylake) processor that powers the brand new LRZ supercomputer: SuperMUC-NG. The presentation will cover details about Skylake core microarchitecture and Xeon uncore design. Additionally, the lecture will provide details about SuperMUC-NG compute node design and the fabric system architecture.

Further information  and registration: https://events.prace-ri.eu/event/822/

PRACE Workshop: HPC code optimisation workshop

Date: Monday, May 20 - Wednesday, May  22, 2019, 9:00-17:00
Location: LRZ
Lecturers: Dr. Fabio Baruffa (Intel), Dr. Mathias Gerald (LRZ), Dr. Luigi Iapichino (LRZ)

Have you ever asked yourself:

  • Where does the performance of my application lay?
  • What is the maximum speed-up achievable on the architecture I am using?
  • Is my implementation matching the HPC objectives?

In this workshop, we will answer these questions and provide a unique opportunity to learn techniques, methods and solutions on how to improve code, how to enable the new hardware features and how to use the roofline model to visualize the potential benefits of an optimization process.

Further information  and registration: https://events.prace-ri.eu/event/872/

PRACE Course: Deep Learning and GPU programming workshop

Date: Monday, June 3 - Thursday, June 6, 2019, 9:00-17:00
Location: LRZ
Lecturer: Dr. Momme Allalen, Dr. Juan Durillo Barrionuevo, Dr. Yu Wang, Dr. Volker Weinberg (LRZ)

Summary: This new 4-days PRACE workshop offered for the first time at LRZ combines lectures about fundamentals of Deep Learning for Multiple Data Types and Multi-GPUs with lectures about Accelerated Computing with CUDA C/C++ and OpenACC.

The workshop is co-organized by LRZ and NVIDIA Deep Learning Institute (DLI) for the Partnership for Advanced Computing in Europe (PRACE).

Further information: https://events.prace-ri.eu/event/860/

Autor: Volker Weinberg

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Sicherheits-Tag 2019 (21.3.)

Datenschutz, Cyber-Crime, Angriffe, Hacker, Firewalls und vieles mehr …

Die Gesellschaft für Datenschutz und Datensicherheit, das Leibniz-Rechenzentrum und die TU München wollen Ihnen diese Themen näher bringen und veranstalten dazu am Do. 21. März 2019 wie im letzten Jahr einen kostenlosen gemeinsamen (IT-)Sicherheits-Tag mit Vorträgen und Präsentationen.

Nähere Informationen finden Sie auf der Veranstaltungs-Webseite, die aktuell gehalten wird:  www.lrz.de/services/termine/2019_sicherheits-tag/

Für die Teilnahme ist kein technisches Vorwissen erforderlich, aber eine Anmeldung;  das Web-Formular ist in der Veranstaltungs-Webseite verlinkt.

Die folgenden Vorträge sind geplant:

Autor: Ernst Bötsch

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Datenschutz-Tag 2019 / 79. Sitzung des GDD-ERFA-Kreises Bayern (22.3.)

Die EU-Datenschutz-Grundverordnung (EU-DSGVO / EU-GDPR) hat mit dem 25. Mai 2018 Geltung erlangt;  ebenso das deutsche Anpassungsgesetz (BDSG) und das Bayerische Datenschutzgesetz (BayDSG).
Das IT-Sicherheitsgesetz ist seit Juli 2015 gültig und der erste Teil wurde ab dem 3. Mai 2016 wirksam.

Viele KollegInnen, die an Bayerischen Universitäten, Hochschulen und in anderen öffentlichen Stellen wie auch in Unternehmen für Sicherheit oder Datenschutz zuständig sind, sind nach wie vor in keiner einfachen Situation:

  • Die Verordnung wie auch die Gesetze haben verschiedene Auswirkungen im täglichen Umfeld, wie auch im strukturellen Bereich (Stichwort "Datenschutz Management System").
  • So manches muss erst noch verstanden und die richtige Umsetzung geplant und aufgesetzt werden.
  • Auch wenn die Gesetze jetzt schon einige Monate gelten und die Verordnung sogar bereits seit Mai 2016 in Kraft ist:  Es gibt oft noch viel zu tun.  …

Die Gesellschaft für Datenschutz und Datensicherheit, das Leibniz-Rechenzentrum und die TU München wollen Ihnen in dieser schwierigen Lage helfen und veranstalten dazu am Fr. 22. März 2019 wie im letzten Jahr einen kostenlosen gemeinsamen Vortragstag.

Nähere Informationen finden Sie auf der Veranstaltungs-Webseite, die aktuell gehalten wird:  www.lrz.de/services/termine/2019_datenschutz-tag/

Eine Anmeldung ist erforderlich;  das Web-Formular ist in der Veranstaltungs-Webseite verlinkt.

Sie sollten auf dem Gebiet des Datenschutzes zumindest ein Grundwissen besitzen, damit Sie die Vorträge sinnvoll nutzen können.  Der Datenschutz-Tag ist keine Einführungsveranstaltung;  Sie müssen also auch damit rechnen, dass teilweise auf Paragraphen eingegangen wird usw.

Die folgenden Vorträge sind geplant:

  • Daniel Kleffel (Präsident des "Landesamt für Sicherheit in der Informationstechnik"):
    Öffentliche IT-Sicherheit durch Technik, Beratung, Prävention.  Das neue LSI in Bayern.

  • Dr. Daniel Rücker, LL.M. (Rechtsanwalt, Partner und Leiter "Datenschutz" bei "Noerr LLP"):
    <Der Vortragstitel folgt noch.>

  • Dr. Sabine Stetter (Fachanwältin für Strafrecht und Steuerrecht und Inhaberin der Kanzlei "stetter Rechtsanwälte"):
    Geldbußen nach der DSGVO

  • Dr. Christoph Wambsganz (Behördlicher Datenschutzbeauftragter beim "Der Bayerische Landesbeauftragte für den Datenschutz (BayLfD)"):
    Datenschutz-Folgenabschätzung – Methodik und Fallbeispiel

  • Michael Will (Ministerialrat und behördlicher Datenschutzbeauftragter im "Bayerisches Staatsministerium des Innern, für Sport und Integration"):
    Datenschutzgesetzgebung – Aktuelles aus Brüssel und Berlin

Autor: Ernst Bötsch

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Parallel computing with MATLAB

On March 11, MathWorks Germany will present a short course at LRZ with the topic "Parallel computing with MATLAB". The course gives an overview of MATLAB's various parallel-computing capabilities and their usage. It will focus on parallelisation of long-running MATLAB jobs, using multiple CPUs, Machine and Deep Learning with MATLAB on GPUs, parallelisation of numerical algorithms as well as scaling parallel MATLAB applications on clusters and cloud.

Further information can be found under https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-03-11_hmat1w18/

Autor: André Kurzmann

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New Deep Learning and GPU Programming Courses

We are happy to announce that LRZ has further extended its programme of Deep Learning and accelerated computing courses offered in collaboration with NVIDIA Deep Learning Institute (DLI).

The workshop series offers hands-on training for developers, data scientists, and researchers looking to solve challenging problems with deep learning and accelerated computing. The program is designed to help you get started with training, optimizing, and deploying neural networks to solve real-world problems across diverse topics such as self-driving cars, healthcare, online services, and robotics.

NEW: Fundamentals of Accelerated Computing with OpenACC @ LRZ

Date: Thursday, March 14, 2019, 9:00-17:00
Location: LRZ
Lecturer: Dr. Volker Weinberg  (LRZ)

Summary: In this workshop you learn the basics of OpenACC, a high-level programming language for programming on GPUs. Discover how to accelerate the performance of your applications beyond the limits of CPU-only programming with simple pragmas. Upon completion, you'll be ready to use OpenACC to GPU accelerate CPU-only applications.

Further information: https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-03-14_hacc1w18/

Fundamentals of Deep Learning for Multiple Data Types @ LRZ

Date: Friday, March 15, 2019, 9:00-17:30
Location: LRZ
Lecturer: Dr. Yu Wang (LRZ)

Summary: In this full-day workshop, you’ll learn how to train a network using TensorFlow and the MSCOCO dataset to generate captions from images and videos. Upon completion, you’ll be able to solve deep learning problems that require multiple types of data inputs.

Further information: https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-03-15_hdlw3w18/

NEW: Deep Learning and GPU programming using OpenACC @ VSC Vienna

Date: Wednesday, March 27 - Friday, March 29, 2019, 9:00-17:00
Location: TU Wien, Austria
Lecturer: Dr. Yu Wang (LRZ), Dr. Volker Weinberg (LRZ), Georg Zitzlsberger (IT4Innovations)

Summary: The 3-days workshop combines lectures about fundamentals of Deep Learning for Computer Vision and Multiple Data Types with a lecture about Accelerated Computing with OpenACC.

Further information: http://vsc.ac.at/training/2019/DL

NEW PRACE Course: Deep Learning and GPU programming workshop @ LRZ

Date: Monday, June 3 - Thursday, June 6, 2019, 9:00-17:00
Location: LRZ
Lecturer:Dr. Momme Allalen, Dr. Juan Durillo Barrionuevo, Dr. Yu Wang, Dr. Volker Weinberg (LRZ)

Summary: This new 4-days PRACE workshop offered for the first time at LRZ combines lectures about fundamentals of Deep Learning for Multiple Data Types and Multi-GPUs with lectures about Accelerated Computing with CUDA C/C++ and OpenACC.

Further information: https://events.prace-ri.eu/event/860/

NEW: Deep Learning and GPU programming using OpenACC @ HLRS Stuttgart

Date: Monday, July 15 - Wednesday, July 17, 2019, 9:00-17:00
Location: HLRS, University of Stuttgart, Nobelstr. 19, D-70569 Stuttgart, Germany
Lecturer:Yu Wang (LRZ), Volker Weinberg (LRZ), Momme Allalen (LRZ)

Summary: The workshop combines lectures about fundamentals of Deep Learning for Computer Vision and Multiple Data Types with a lecture about Accelerated Computing with OpenACC.

Further information: http://www.hlrs.de/training/2019/DL1

All lectures are interleaved with many hands-on sessions using Jupyter Notebooks. The exercises will be done on a fully configured GPU-accelerated workstation in the cloud.

All involved instructors are NVIDIA certified University Ambassadors.

Please also pass this course announcement to other interested colleagues.

Autor: Volker Weinberg

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Introduction to Semantic Patching of C programs with Coccinelle

We are pleased to announce that the Leibniz Supercomputing Centre will offer a new course "Introduction to Semantic Patching of C programs with Coccinelle" for advanced C/C++ programmers.

Date & Location

Thursday, April 4, 2019, 10:00 - 17:00
Leibniz Supercomputing Centre (LRZ) of the Bavarian Academy of Sciences and Humanities, Garching near Munich, Boltzmannstr. 1, Kursraum 2, H.U.010

Course Description

The maintenance of a large software project can be very demanding. External factors like evolving third-party software library APIs, or constantly changing hardware platforms might require significant code adaptions for the code to run efficiently, or to run at all. Failure in coping with this can lead to obsolescence, loss of performance, incompatibility, vendor lock-in, bugs.

Have you ever wondered how to detect and manipulate specified classes of C code constructs, be it for code analysis, or better, to restructure an arbitrarily large codebase according to a specified, non-trivial `pattern', without writing a C compiler?

In this training we introduce you to a tool to do exactly this: match and restructure C codebases in a programmatic, formal way. The training will also show how to analyze code looking for interesting patterns (e.g. bugs), integrate with your Python scripts to achieve the custom transformations you need, and leverage Coccinelle's limited C++ support. Special attention will be on performance-oriented transformations, of other interests of HPC practitioners.

After this training, you shall be able to write your own code transformations, be it for a refactoring, performance improvement, paving the way to an experimental fork, or for debugging and further analysis.

Teacher

Dr. Michele Martone (LRZ)

Registration and further information

https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-04_hspc1s19/

Please also pass this course announcement to other interested colleagues.

Autor: Volker Weinberg

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Training on data analytics, big data and machine learning workflows at LRZ

In addition to supporting traditional HPC applications, the Leibniz Supercomputing Centre (LRZ) is offering systems and services to address the increasing demand of data analytics, big data and machine learning workflows. In a series of trainings, we will provide introductory courses for researchers and students who want to utilize LRZ resources for tasks of this nature.

The "opening session" on Tuesday, April 9th will provide an "Introduction to the LRZ Supercomputing & Machine Learning Infrastructure". Attending this full day course will give you an overview of the high performance computing hardware and software services available at LRZ and you will learn how to utilize these systems, focusing on different machine learning tools and applications.

For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-09_hsmi1s19/

A follow-up training on Wednesday, April 10th will take a deep-dive into "Using R at LRZ". This full day workshop will illustrate the different possibilities of utilizing R for data analytics and machine learning tasks on various LRZ systems by providing guidelines and best practice examples.

For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-10_hurl1s19/

On Thursday, April 11th an Intel Artificial Intelligence Workshop will highlight the usage of Intel's optimized performance libraries underneath popular machine learning frameworks. The workshop includes hands-on sessions around classical machine learning as well as deep learning on HPC systems. Besides introducing the transparent usage of performance libraries, the focus will be to empower participants to scale their deep learning (TensorFlow) application training on distributed HPC systems.

For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-11_hiai1s19/

Finally, on Friday, April 12th we will offer a "Using Python at LRZ" workshop. In this refresher course, different Python topics of interest to data analytics/machine learning practitioners and distinctive use cases of high performance computing environments will be covered.

For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-12_hupl1s19/

If you have any questions regarding these trainings prior to registration, feel free to contact Dr. Johannes Albert-von der Gönna (johannes.albert-vondergoenna@lrz.de).

Autor: Volker Weinberg

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Girls' Day 2019 am Leibniz-Rechenzentrum

LRZ – Mit uns könnt ihr rechnen? – Nicht nur!

Das Leibniz-Rechenzentrum (LRZ) der Bayerischen Akademie der Wissenschaften ist seit über fünf Jahrzehnten der IT-Partner der Münchner Universitäten und Hochschulen. Wir bieten die komplette Bandbreite an IT-Dienstleistungen und -Technologien, aber auch Beratung und Support – von E-Mail, Webserver, bis hin zu Internetzugang, virtuellen Maschinen, Cloud-Lösungen, dem Münchner Wissenschaftsnetz (MWN) und natürlich Supercomputern. Apropos Supercomputer, wir haben mehrere bei uns am LRZ, unter anderem einen der schnellsten Rechner Europas: unseren SuperMUC-NG. Und genau den können Mädchen am Girls' Day besuchen!

Girls' Day 2019 am Leibniz-Rechenzentrum

Am 28. März ist es wieder soweit: Wir öffnen unsere Türen für interessierte Mädchen. Was sie beim Girls' Day 2019 am LRZ erwartet? –Wir lassen Hashtags darauf antworten:
#Supercomputer #SuperMUC-NG #Visualisierung #VirtuelleRealität #Photogrammetrie #3DModell

Beim Girls' Day am LRZ zeigen wir, wie man virtuelle 3D-Modelle erstellen kann mit Hilfe von Photogrammetrie. Wir starten unseren Kurs mit einer Fotosession, für die ein Smartphone oder eine Digitalkamera benötigt wird. Gemeinsam wird ein Objekt von allen Seiten fotografiert, um dann aus den Fotos schließlich ein 3D-Modell berechnen zu lassen. Natürlich erklären wir ausführlich wie das geht, wie es personalisiert werden kann und wie das 3D-Modell anschließend mitgenommen werden kann.

Während das Programm die Modelle berechnet, haben die Mädchen die Möglichkeit, in unserem Zentrum für Visualisierung und Virtuelle Realität (V2C) die 5-seitige Projektionsinstallation und in unserem HMD-Lab Head-Mounted Displays zu erkunden.

Und zu guter Letzt findet ein Rundgang mit den Mädchen durch unseren Rechnerwürfel mit den Superrechnern, SuperMUC und SuperMUC-NG statt.

Autorin: Petra Gärtner

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Next HPC Courses and Workshops at LRZ

Following, please, find a list of the next HPC courses at LRZ
Parallel computing with MATLAB
Monday, March 11, 2019 13:30 -16:00
NVIDIA DLI Course: Fundamentals of Accelerated Computing with OpenACC
Thursday, March 14, 2019, 9:00-17:00
NVIDIA DLI Course: Fundamentals of Deep Learning for Multiple Data Types
Friday, March 15th, 2019, 09:00-17:30
PRACE Course: Advanced Topics in High Performance Computing
Monday, March 18, 2019 - Thursday, March 21, 2019, 9:00-17:30
Deep Learning and GPU programming using OpenACC @ VSC Vienna
Wednesday, March 27 - Friday, March 29, 2019, 9:00-17:00
Introduction to Semantic Patching of C programs with Coccinelle
Thursday, April 4, 2019, 10:00 - 17:00
Introduction to ANSYS Fluid Dynamics (CFX, Fluent) on LRZ HPC Systems
Monday, April 8 - Friday, April 12, 2019, 09:00-17:00
Introduction to the LRZ Supercomputing & Machine Learning Infrastructure
Tuesday, April 9, 2019, 9:00-17:00
Using R at LRZ
Wednesday, April 10, 2019, 9:00-17:00
Intel Artificial Intelligence Workshop
Thursday, April 11, 2019, 9:00-17:00
Using Python at LRZ
Friday, April 12, 2019, 10:00-15:00
PRACE Workshop: HPC code optimisation workshop
Monday, May 20 - Wednesday, May 22, 2019, 9:00-17:00
PRACE Course: Deep Learning and GPU programming workshop
Monday, June 3 - Thursday, June 6, 2019, 9:00-17:00
Advanced C++ with Focus on Software Engineering
Wednesday, June 12 - Friday, June 14, 2019, 9:00 - 17:00
Deep Learning and GPU programming using OpenACC @ HLRS Stuttgart
Monday, July 15 - Wednesday, July 17, 2019, 9:00-17:00
Introduction to ANSYS Fluid Dynamics (CFX, Fluent) on LRZ HPC Systems
Monday, September 2 - Friday, September 6, 2019, 09:00-17:00
Advanced C++ with Focus on Software Engineering
Wednesday, November 20 - Friday, November 22, 2019, 9:00 - 17:00
C++ Language for Beginners
Monday, November 25 - Friday, November 29, 2019, 9:00 - 17:00
Past Courses
Archive of previous courses
Other Courses
Courses at other GCS and PRACE locations
Resources
Lecture Notes of Courses & Workshops

Information on further HPC courses:

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Stellenangebote / Job Opportunities

Sie finden alle aktuellen Stellenangebote des LRZ immer auf unser Webseite www.lrz.de/wir/stellen/.

You will find all job opportunities at LRZ, some of them in English, on our web page www.lrz.de/wir/stellen/.

Impressum

Herausgeber:
Leibniz-Rechenzentrum der Bayerischen Akademie der Wissenschaften

Anschrift:
Leibniz-Rechenzentrum der Bayerischen Akademie der Wissenschaften
Boltzmannstraße 1
D-85748 Garching

Telefon: +49-89-35831-8000
Telefax: +49-89-35831-9700
E-Mail: lrzpost_AT_lrz.de

Redaktion: Dr. Ludger Palm

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Stand: 2019-03-07

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